联邦星舰精进号发射光子鱼雷
鱼雷是一种自推进的自导武器，22-24世纪间，联邦的大部分船舰都以此为主武器。
它最初被设计用以在战斗中替代定向能武器，如裂解炮与相位武器，但可以进行多次改装来应对不同任务。通常战斗部不会被卸下，不同型号的战斗部有不同的爆炸范围。鱼雷发射管收到舰桥的命令后便可以将管中的鱼雷发射出舱，当然，也可以手动操作。大部分时间，截获目标与下达命令的任务由战术官完成。
罗慕伦的一艘战鸟正在发射等离子鱼雷
鱼雷的有效射程取决于它的型号，与推进及制导系统息息相关。一般将鱼雷以“是否可以曲速飞行”进行分类。一些鱼雷安装有自毁系统，如果目标选错了，鱼雷便可以终止程序，自动摧毁。
鱼雷拥有遥感系统，战术官设定目标时会启用它。因此，一个目标可以同时被几枚鱼雷击中，从而让爆炸伤害最大化。必要时，感应器可以升级为感应组。
在20世纪的地球，美国海军训练鲸鱼回收鱼雷。
联邦星舰挑战号发射量子鱼雷
不同的鱼雷有不同的作用，共有如下几种：
- 进阶远距鱼雷，一种无法被检测到的光子鱼雷，由平行时间线的可汗·努尼恩·辛格研发。
- 反物质鱼雷，凯莱曼人的一种反物质武器。
- 时间鱼雷，基理林帝国一种时间通量中的鱼雷。
- 重力鱼雷，星际舰队使用的一种可以释放强引力场的武器。
- Isolytic burst，Son'a的一种子空间武器。
水母号开火
- 光子化鱼雷，星际舰队与维西亚人的一种反物质武器。
- 等离子鱼雷，一般由罗慕伦星际帝国、卡达西联盟以及卡松配备。
- 脉冲鱼雷，可以消除子空间异常的鱼雷。
- 量子鱼雷，星际舰队、地球义军以及卡达西联盟使用的高级武器。
- 第5号远距战术装备，卓达人研发的反物质鱼雷。
- 空间鱼雷，22世纪星际舰队使用的一种氚核空间武器。
- 同温层鱼雷，星际舰队与马奇游击队使用的大气层内武器。
- 超相位鱼雷，平行时间线中凯瑟琳·珍妮薇舰长为对抗博格研发的武器。
